派森诺生物MiSeq测序仪成功升级
时间：2012-11-1 来源：派森诺生物 关键词：MiSeq 测序 升级
作为中国区第一家引进Illumina MiSeq的高通量测序公司—— 上海派森诺生物科技有限公司，已于9月底率先实现了MiSeq 测序仪的全面升级，升级后的MiSeq在读长和通量方面都有了大幅度提升。
近日，派森诺生物已**完成升级后的首次上机测试。此次测试采用2*250bp的读长模式，共获得了8.2G的数据通量，且Q30达到70%以上，这一数据完全达到了Illumina官方公布的数据标准，标志着派森诺生物MiSeq测序仪升级的全面成功，今后将正式投入项目使用。
升级后性能参数：
测序时间和数据
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读长 (bp)
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时间
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总数据量
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Q30
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1 × 36
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~4 hrs
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540-610 Mb
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> 90%
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2 × 25
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~5.5 hrs
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750-850 Mb
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> 90%
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2 × 100
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~16.5 hrs
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3.0-3.4 Gb
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> 85%
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2 × 150
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~24 hrs
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4.5-5.1 Gb
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> 80%
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2 × 250
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~39 hrs
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7.5-8.5 Gb
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> 70%
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读取量比对
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运行类型
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通过过滤的读取（百万）
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升级前
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升级后
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单端读取
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5-7 M
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15-17 M
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末端配对读取
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10-14 M
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30-34 M
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据派森诺生物的技术研发人员介绍，MiSeq升级后的测序读长达到2*250bp，这一升级的读长模式不仅大大提升了其在微生物基因组学、转录组学研究的技术优势，而且显著拓宽了其在宏基因组学、扩增子测序等项目中的应用。其优势主要体现在以下几个方面：首先，升级后的MiSeq测序通量显著增加，使得其在测序周期短的优势基础上，性价比也有了明显改善；其次，2*250bp的读长能够更有效地跨越复杂基因组的高度重复区域，显著提高基因组及转录组的从头拼装结果，优化的组装结果将更有利于进行基因注释和基因功能的深入挖掘；再次，读长的优势将有利于发现更多的可变剪切和新转录本的预测，提高分析结果的准确性。可以说， MiSeq测序仪的全面升级，有助于我们提供更快、更好的基因组测序服务，为科研工作者带来了便利。
派森诺生物总经理指出，新一代测序仪的升级，对我们来说既是机遇也是挑战，这次我们很好地完成了上机测试，可以说完美地接受了这次挑战，相信我们能以此为契机，在以后的科研合作中，为更多合作者提供更优更全面的服务。